Conseil et formation en bioinformatique
Pour les chercheurs, laboratoires, médecins, vétérinaires et entreprises : Sycomia vous aide à optimiser vos analyses, à gagner en autonomie et à accélérer vos projets scientifiques.
Catalogue de formations
Chaque module s’adapte à votre équipe. Les programmes peuvent combiner plusieurs modules.
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Bash, Linux et Git
Travailler en ligne de commande, organiser et versionner ses projets.
- Niveau
- Débutant
- Public
- Biologistes, chercheurs
- Prérequis
- Aucun
-
Python pour la biologie
Manipuler, analyser et visualiser des données biologiques.
- Niveau
- Débutant
- Public
- Biologistes, chercheurs
- Prérequis
- Aucun
-
R et Bioconductor
Statistiques et analyse de données omiques avec R.
- Niveau
- Débutant
- Public
- Biologistes, chercheurs
- Prérequis
- Aucun
-
Docker, Nextflow, Snakemake
Des analyses reproductibles, qui tournent partout à l’identique.
- Niveau
- Intermédiaire
- Public
- Bioinformaticiens, analystes
- Prérequis
- Ligne de commande
-
Analyse RNA-seq bulk
Du contrôle qualité à l’expression différentielle et à l’enrichissement.
- Niveau
- Intermédiaire
- Public
- Biologistes, bioinformaticiens
- Prérequis
- Bases de R
-
Détection de variants
Alignement, appel et annotation de variants à partir de WGS ou WES.
- Niveau
- Intermédiaire
- Public
- Biologistes, bioinformaticiens
- Prérequis
- Ligne de commande
-
Single-cell et spatial
Clustering, annotation, trajectoires et transcriptomique spatiale.
- Niveau
- Avancé
- Public
- Bioinformaticiens
- Prérequis
- R ou Python, bases du RNA-seq
-
IA appliquée à la biologie
Les principes du machine learning, puis des cas concrets en biologie.
- Niveau
- Avancé
- Public
- Bioinformaticiens, data scientists
- Prérequis
- Bases de Python
FormatsAteliers interactifsSessions en ligneModules intensifsSur site, dans vos locaux
Besoin d’un avis plutôt que d’une formation ?
Un expert vous accompagne sur votre projet, ponctuellement ou dans la durée.
Parler de votre projet- Choisir les bonnes méthodesTechnologies, plan d’expérience, outils d’analyse : les bons choix avant de lancer le projet.
- Fiabiliser vos pipelinesAudit et conception de workflows reproductibles avec Nextflow ou Snakemake.
- Intégrer l’IAÉvaluer ce que l’apprentissage automatique peut apporter à vos questions.
- Suivre votre équipeRelecture d’analyses et de code, aide au déblocage, montée en compétences progressive.
Questions fréquentes
Une autre question sur votre projet ? Écrivez-nous, un expert vous répond.
Nous contacterÀ qui s’adressent vos formations ?
Aux chercheurs, laboratoires, médecins, vétérinaires et entreprises, à tous les niveaux : des débutants sans expérience de programmation aux utilisateurs avancés.
La formation peut-elle être adaptée à notre équipe ?
Oui. Les programmes sont entièrement personnalisables, sur le fond comme sur la forme : ateliers interactifs, sessions en ligne ou modules courts intensifs.
Pouvez-vous nous aider à mettre en place nos propres pipelines ?
Oui. Nous vous aidons à concevoir des workflows robustes et reproductibles avec Nextflow ou Snakemake, et formons votre équipe à les utiliser et à les maintenir.
Mes données restent-elles confidentielles ?
Oui. Nous signons un NDA sur simple demande, avant tout échange de données. Vos données sont traitées sur nos propres serveurs, les données cliniques sont hébergées en France chez un hébergeur de données de santé certifié (HDS), et vos données sont effacées dans les 30 jours suivant la fin du projet, ou plus tôt à votre demande, conformément au RGPD.
Services associés
Prêts à renforcer les compétences de votre équipe ?
Parlez-nous de votre équipe, de vos projets et de vos objectifs : nous construisons le bon programme de conseil ou de formation.