Protéomique

Protéomique Ciblée

Notre équipe accompagne l’analyse des données issues de la technologie Olink® PEA, permettant une quantification protéique sensible et multiplexée à travers des panels clés tels que Target 96, Explore HT et Reveal. Grâce à des workflows bio-informatiques robustes, nous assurons une découverte de biomarqueurs fiable ainsi qu’une interprétation complète des données, en adéquation avec vos objectifs de recherche.

Nous proposons des analyses bio-informatiques spécialisées pour les données SomaScan®, permettant le profilage à haut débit et à haute sensibilité jusqu’à 11 000 protéines. Nos workflows sur mesure offrent une interprétation approfondie pour accélérer la découverte de biomarqueurs et faire progresser vos objectifs de recherche.

Nos bio-informaticiens réalisent une analyse statistique approfondie des données issues d'immuno-essais multiplexés, garantissant une quantification précise et une comparaison cohérente entre groupes d’échantillons. Cela permet une validation fiable des biomarqueurs et une interprétation biologique pertinente.

Protéomique basée sur la Spectrométrie de Masse non ciblée

Nous assurons l’identification précise de protéines et de peptides à partir de données de spectrométrie de masse non ciblée. Grâce à des pipelines bioinformatiques avancés et à des bases de données de référence soigneusement sélectionnées, notre approche garantit des résultats fiables, adaptés à un large éventail d’applications biologiques et biomédicales.

Nous assurons une quantification fiable des protéines et peptides à partir de données de spectrométrie de masse non ciblée, en appliquant des méthodes statistiques et informatiques robustes pour une comparaison précise entre échantillons complexes.

Nous réalisons des analyses d’expression différentielle des protéines afin d’identifier les variations significatives entre différentes conditions expérimentales. Cette approche favorise la découverte de biomarqueurs, l’annotation fonctionnelle et une meilleure compréhension des mécanismes biologiques sous-jacents.

Protéomique fonctionnelle

Chez Sycomia, nous analysons les réseaux d’interactions protéine-protéine issus des données de protéomique afin de révéler les relations fonctionnelles clés et les voies de régulation. Cette approche permet de décrypter des systèmes biologiques complexes et d’apporter un éclairage sur les mécanismes cellulaires.

L’expertise bio-informatique de Sycomia permet l’annotation précise des domaines et motifs protéiques, offrant des éclairages précieux sur la fonction, la structure et les capacités d’interaction des protéines. Cette annotation fine contribue à une meilleure compréhension du rôle des protéines dans les processus biologiques et facilite l’identification de cibles potentielles pour des recherches approfondies.

Nous réalisons des analyses complètes d’enrichissement fonctionnel à partir des bases de données GO et KEGG afin d’identifier les processus biologiques et voies métaboliques significativement représentés dans vos données de protéomique. Cette approche met en évidence les fonctions clés et facilite l’interprétation de jeux de données complexes.

Intégration multi-omique centrée sur la protéomique

Nous intégrons les données de protéomique et de transcriptomique pour révéler la complexité des mécanismes biologiques. La corrélation entre l’abondance des protéines et l’expression des ARN permet de mieux comprendre les processus de régulation et d’optimiser la découverte de biomarqueurs.

Nous utilisons des approches bio-informatiques avancées pour inférer les voies biologiques et les réseaux d’interactions à partir des données protéomiques, révélant ainsi les mécanismes moléculaires importants et les dynamiques à l’échelle du système.

Notre équipe utilise des algorithmes d’apprentissage automatique de pointe pour stratifier les échantillons à partir des données protéomiques, permettant une classification précise, la découverte de sous-groupes, et des analyses personnalisées.

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